Ⅰ 求柯南同人文。（完結，穿越）
下面我給你推薦一些我覺得不錯的柯南同人文。
1.柯南請接招 男主柯南
2.柯南之工藤希 男主基專德
3.柯南同人之曖昧屬初夏 男主柯南 本文有雷區，請慎入。
4.柯南同人之迷惘 男主柯南
5.名偵探柯南之賴上基德殿下 男主嘛，不用上，看名字就知道了。
6.當腹黑女穿越到柯南的世界 男主基德
7.名偵探柯南之習慣在你身邊 這個是灰原哀和柯南在一起。
8.柯南之冷酷公主腹黑女 男主柯南，這個和3.一樣有雷區，請慎入。
以上，完畢。滿意請採納。這些是全免費的。在小說閱讀網里可以找到。
Ⅱ 名偵探柯南同人小說完結
1 .（柯南同人） 世界上除了青山大神外唯一知道內幕的作弊穿越
文章簡介——
當你發現你穿越了後會有什麼感受？
當你發現你穿到的是那個沒有念能力，沒有靈力，但是卻是犯罪率極高的柯南世界時，又會有什麼感受？
那當你發現你是黑暗組織leader的孫女，組織的第二繼承人時，你還會有什麼感受？
三個字.....
——.救命啊！！！！！
PS:看起來貌似文案很小白，女主背景很瑪麗蘇，但是其實這文一點也不白，不蘇。
絕對是難得一見的柯南好文！！！——除了標題很RP，讓小卡很怨念以外。。。
2.（柯南同人）黎明前夕
文章節選——
好不容易，我恢復了神志，看著手上的鑽戒——這下使木已成舟，賴都賴不掉了！可是，小蘭的捧花怎麼會好巧不巧落到我手上？！
我抬頭看著那對新人：新一是一臉得意；小蘭的臉上……我沒看錯吧，我怎麼從她臉上看到了抱歉？？難道……
——這次的伴娘就算了，不過下次的喜酒我可是吃定了！
不會吧！我趕忙再瞅瞅平和、快青，不是吧，都是一幅瞭然於胸的表情，難道至始至終只有我一個人蒙在鼓裡？！！可惡，連小蘭也騙我，這種感覺真的、真的——
很——討——厭！！！
不過「敵眾我寡」，現在我只能把矛頭對准一個人：
「白馬探，這輩子你別想翻身了！！」
二。名偵探柯南同人BL系列
1。【柯南同人】白日做夢
文章簡介——
再沒有什麼，比一覺醒來看見自己的臉更為驚悚的事。
黑羽快斗很不幸的成為其中之一。
他以為，這只不過是個普通的不必在意的噩夢。
但被小泉紅子的怨念附身的老天爺很慈祥地告訴他——
那僅僅是份餐前甜點，主食還在後頭。。。
2.【名偵探柯南】血色纏綿
範本西是個溫潤的男人，卻有著倔強的天性。
他不想去計較來到這個世界的原因，他只想活下去
——和那個男人一起活下去。
哪怕鮮血滿身，也絕對不離不棄！
主角死後重生名偵探柯南的世界，第一人稱。
為了不蘇所以可能出現代入感不強的缺陷。非劇情君。
3. 從還魂開始的異世之旅
女主遇見受到詛咒的貓，從此進入柯南世界冒險
在和柯南一起面對各種案件謎題的時候，另一條隱含的線也在展開——
——守護寶石潘多拉的一個種族，因潘多拉遺失而受到詛咒，族人都變成了貓。五個守護者各繼承一枚守護石，擔負起尋找潘多拉的主要任務……而空之石第六代繼承人，在遇見女主後，用其穿越時空的力量，幫助女主進入柯南世界
女主逐漸與柯南中的主要人物接觸，同時原本分散在各地的守護者也接連出現……到底在不為人知的背後，隱藏著怎樣的秘密？守護者為何集中起來了？
而女主靈魂穿越後借用的身體，屬於一個被捲入陰謀的小女孩，本來死去的女孩，在女主靈魂的驅使下「重生」，便又引發一場偵探與黑衣組織的較量
無簡介：
柯南同人之伊舞天空
成神之穿越柯南
對不起新一,我愛上了柯南
柯南同人之我是你的專屬
柯南我只在乎你
我和步美搶柯南
穿越守護甜心和柯南世
柯南 月下魔術師
怪盜的愛戀物語
Ⅲ 求穿越到名偵探柯南的完本同人小說
從還魂開始復的異世之旅制 （暫時還沒有完整的網路文庫的）
新的彼岸
名偵探柯南之飄
永遠的青空
柯南 月下魔術師73
穿越之柯南世界（原劇情）
(網王+柯南)命運的羈絆
穿越柯南之黑貓Blacky之幻夏
刺桐之歌
錯過後的幸福 原名：《始終，錯過》
說好的，我會保護你(網王+柯南)》
攻陷我的王子
花·舞 作者:竹幽深處 魔女名偵探
【同人穿越】雪色的曼珠沙華（柯南主，網王客串）
不過裡面有沒完結但是很多人都推薦的~希望對你有幫助
Ⅳ 求名偵探柯南同人小說 要完結的 女主穿越的，越多越好
柯南同人——絮殿夕恩的前夜
[網王+柯南]錯過後的幸福
[柯南]星空爍玥
當我們進入柯南的世界
穿越之柯南的世界
爆笑穿越：魔女名偵探（柯南同人小說） 作者：第一次寫文，請...
http://tieba..com/f?kz=549308929
原創】我的超special暑假——與柯南共度(穿越)
http://tieba..com/f?kz=615361334
【新人原創】柯南世界之旅——異界樂章（初二學生的處女作）
http://tieba..com/f?kz=625526469
【重寫+穿越】幻穿越之愛麗絲（輕喜劇）
http://tieba..com/f?kz=611912230
【不是穿越的穿越】 原創 薔薇花下
http://tieba..com/f?kz=623669213
【別樣穿越】《河淙》——給現實和虛幻共存的兩個世界
http://tieba..com/f?kz=614291351
<推理狂，本小姐欣賞你！！！>(精品)
作者： 上川純美
地址：http://post..com/f?kz=255702955
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＜柯南的半個救星＞（精品）
作者： 江戶川愛琳
地址：http://post..com/f?kz=261664680（貌似不是穿越的，但滿有趣的）
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＜柯南同人文——穿越 ＞（精品）
作者： 雪舞の怡
地址：http://post..com/f?kz=237154665
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＜（原傳＋惡搞）柯南一夢＞（精品）
作者： 富之雪※櫻友
地址：http://post..com/f?kz=209960998
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＜【魔法穿越文】我和73闖柯南世界☆原創★ ＞（精品）
作者： 雪秋天
地址： http://post..com/f?kz=266414545
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＜穿越柯南的世界～（新★蘭）＞
作者：仆は神※樂￠
地址：http://post..com/f?kz=264367315
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＜ohoh~~~我來到了柯南的世界! ＞
作者： 蒼月琉星
地址：http://post..com/f?kz=263303030
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＜穿越之吟遊者的插入＞
作者： AH夏
地址：http://post..com/f?kz=296482906
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＜穿越 新一，真相，告訴她！＞
作者： 諾維爾の姊
地址：http://post..com/f?kz=292939872
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＜柯南穿越文（無名） ＞
作者： 黑羽紫媛
地址：http://post..com/f?kz=252172251
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＜看福爾摩琪文有感之我也進入柯南世界＞
作者： 工藤艾琳
地址：http://post..com/f?kz=253829186
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＜穿越時光之輪（新蘭） ＞（精品）
作者： 憶の戀薰
地址：http://post..com/f?kz=241290228
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＜進入柯南的世界後........... ＞
作者： 藤原純沅
地址：http://post..com/f?kz=292929307
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＜進入!柯南世界!＞
作者： CONAN新蘭永恆
地址：http://post..com/f?kz=292616454
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＜柯南—穿越文（我來到了conan的世界！） ＞
作者：......（無名）
地址：http://post..com/f?kz=298325882
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＜偵探之名 ＞
作者： ぁ麻倉め雲
地址：http://post..com/f?kz=293044206
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＜穿越文 －－新蘭＞
作者： 清宮夏美
地址：http://post..com/f?kz=290865920
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＜穿越時空的美麗故事（長篇小說）＞
作者： 奇奇哈兒
地址：http://post..com/f?kz=243419238
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＜穿越文之柯南＞
作者：......（怎麼又是一個無名人士）
地址：http://post..com/f?kz=295910113
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＜美戰柯南穿越文＞
作者：......（又一個無名的...不過自稱：小螢）
地址：http://post..com/f?kz=297630154
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＜我進入柯南的世界（案件均為原創，如有雷同，純屬巧合） ＞
（第一部）
地址：http://post..com/f?kz=232961610
＜福爾摩琪的第二部《綺里重返》（專職推理的穿越文） ＞
作者： 福爾摩琪♀
地址：http://post..com/f?kz=263476439
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＜違背組織和命運的眼淚＞
作者： 孝卿
地址：http://post..com/f?kz=302531712
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＜【原創】穿越柯南的世界-----什麼叫真情 ＞
作者： 藤楓瑩
地址：http://tieba..com/f?z=283146663&ct=335544320&lm=0&sc=0&rn=50&tn=PostBrowser&word=%BF%C2%C4%CF&pn=100
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＜來到柯南世界.... ＞
作者： ぁぃ淚
地址：http://tieba..com/f?kz=304984638
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＜穿越文：柯南的神（連載） ＞
作者： 千米翱
地址：http://post..com/f?kz=298081556
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＜（穿越文）穿越到柯南的世界 ＞
作者： 雪白中的血紅
地址：http://post..com/f?kz=293227882
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＜穿越只為遇見你{有那麼點惡搞……} ＞
作者： SherryMalfoy
地址：http://post..com/f?kz=307566572
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＜魔法穿越文＞
作者： 彗野明美
地址：http://tieba..com/f?kz=309021744
Ⅳ 名偵探柯南的同人小說100萬字以上
真的完本的很少復。幾年前也制心血來潮找過一陣子，現在我能記起來看過不錯的就只有混吃等死，以吾之名，不明殺手，惡魔守護，移動炸彈，這幾個。血色深情勉強算，就是太短了。百萬字以上的真的很少，不追究字數，看著還好的更少……
Ⅵ 名偵探柯南大結局新蘭同人小說
一、苦澀
自從那天起，她再也沒看過報紙。
如同在躲避著什麼，每當郵差把報紙送到她的手中，她總是刻意的閉上眼睛，摸索著走到屋裡，把報紙揉碎，扔進垃圾桶。
還伴隨著或少或多的淚水。
她知道他是記者的寵兒，伴隨著他的歸來，她也曾經興奮地打開報紙，不管旁邊密密麻麻的字體，傻笑的准備看。
可在一瞬間，笑容就僵在了她白皙的臉上，無意間，透明無色的淚水無聲的劃過她的面容。
她想忽視這晶瑩剔透的淚，「拿她當水好了，」她自我安慰的想，「就當是水，反正今天下雨。」
可是，她無法忽視，因為水是無味的，為他流的淚，卻是苦澀的。
二、笑容
她永遠忘不了那天他的微笑，和他身邊的女孩。
女孩茶色的頭發，一雙精緻的鳳眼炯炯有神，她嘴角掛著寧靜的微笑，一瞬間，毛利蘭有些恍惚，那笑容，好美，美得放肆。
美的讓她心裡好痛。
他笑：「蘭，不祝福我們嗎？」
他是在故意刺激自己嗎？
她心中怔怔得想。
她也微笑，努力讓自己的笑容比別人的更美——可她做不到，因為笑不出來，只能勉強的上揚嘴角——她連把牙齒露出來的力氣都沒了。
「祝你們幸福。」她刻板的說。
「你好。」女孩友好的對她眨眼睛，在她看來卻像是嘲笑。女孩對她自我介紹：「我叫宮野志保。」
她從今記住了這個脫俗的名字，以至於後來婚後，她還拉著他的手，撒嬌耍賴要他從此再也不許提這個名字。
她並不恨他，更不恨志保。
她只恨自己只會等，只會等，等到最後——
竟然連笑的勇氣都沒有了。
三、朋友
歸來後，這是他第二次踏入她的家門。
她讓自己顯得自然，手指捏住自己的白裙子，努力把自己心裡還在燃燒的情感藏了起來，裝作平靜的說：
「工藤，有事嗎？」
她看到他愣了幾秒，不止是為她的稱呼，還是因為她故作的冷淡。
「蘭，你今天下午……有空嗎？」他有些磕磕巴巴的問。
「什麼事？」她得體的回答。
「下午記者要跟蹤我們去游樂園，志保正好沒空，你能……裝扮成志保代替一下嗎？」
她眼神迷茫的望著他。
他是在邀請自己嗎？
「我沒她長得漂亮，」她回答，眼神里沒有了感情，一片漆黑。
也許是被她的話語和表情嚇到了，工藤竟然向後退了一步。
「沒關系，」他很快恢復正常，「化一下妝就可以了，頭型可以戴假發。」
「我只想做好我自己。」她婉轉的拒絕。
「拜託啦，你就看在是我朋友的份上幫我一下好了。」
朋友？
哦，大恍然大悟，原來在他眼裡，自己只是朋友。
四、撒嬌
最後，她還是答應了他的請求，因為心硬不起來，看到他，不自覺就答應了。
自己好傻，真的好傻。連最基本女孩子的矜持都不會。
那一天，他們去了游樂園，他來接的她，這一次，他第一次沒有遲到，第一次到她家裡接她。
「原來對志保你從來不遲到啊。」她喃喃的低語，不在乎他聽沒聽見。
她穿的是白色的體恤衫配深色牛仔長褲，襯衫的扣子松開了一個，露出層次感強烈的鎖骨，下身緊身的長褲襯出修長的腿和保持完美的身材。
她決定了，今天她要快樂起來，高興起來，幸福起來！反正早晚要面對，她是能幸福一分鍾就幸福一分鍾，能在他身邊讓他再愛一分鍾就再愛一分鍾——雖然只是替代品。
她做著他的車來到游樂場，她微笑，今天她可以肆無忌憚的跟他撒嬌耍賴，因為是替代品，到時候報紙印出來這些舉動就是志保的。
她戴上了假發——她會易容，他媽媽有希子教她的，只不過沒想到是用來干這個。
他凝視了她好久，說：
「很漂亮。」
他愣住，不知道他是在說志保還是說她。
他們到了游樂場，她熟悉這個游樂園，一上來就哭著喊著讓他去幫她到游樂園的另一端去買星巴克咖啡，而且要冰的，拿回來的時候咖啡上的冰激凌不許化。
她看著他滿頭大汗的為自己買回來，本以為會高興，心裡卻冰涼。
她把咖啡一飲而盡，覺得胃裡更冷了。
他看她喝完，微笑，拉起她的手，拉她往裡走。
五、心跳
她們把游樂場里所有的項目都玩完了，不管是刺激的，幼稚的，浪漫的。
坐過山車的時候，她裝作一臉幸福的問：「如果我摔下去了，你會救我嗎？」
他看她，驚訝：「在誰的情況下？」
她沒心情問了。
她捂著眼睛把所有刺激的項目都玩了，她筋疲力盡，撒嬌要他抱。
從前，她從不敢這么囂張，不過現在沒關系，她是志保，所以沒關系。
她被他橫抱在懷里聽他的心跳，她數過了，他的心跳一下自己的心就會跳三下。
她臉紅，緊張，心跳加快，手腳不知道應該往哪裡放。
她睡著了，不知道睡了多久，忽然被他叫醒。
她跟他說：「抱歉我睡著了。」
他沒回應，只是微笑，問：「記得這里嗎？」
當然記得，她在心裡說，她永遠記得這里，這個噴泉，那次他的倒數，還有……
她笑，無意識的將碎頭發捋到耳朵後面去。卻猛然發現——自己的假發掉了！！！
她頓時慌了，小心翼翼的問他：「工藤，我要不要找個地方躲起來？」
「為什麼？」他問。
「假發……」她張口，欲言又止。
「我摘的。」他平靜的回答她。
她愣住：「為什麼？！」
「蘭，對不起啊。」他凝視她，笑的溫柔。
「是說志保嗎？沒關系，放我下來吧。」她語氣很平靜，似乎心裡的傷痕已經撫平。
「笨！你還沒搞清楚我說什麼！」他不但沒有放他下來，反而把她抱得更緊了。
她看他，深呼吸。
「我是說——」工藤新一無奈的搖頭，將她抱在自己懷里，「對不起，我愛你。」
微風吹過，毛利蘭沒發覺。
她看著新一，表情瞬息萬變，驚訝，奇怪，羞澀，……各種各樣，無一重復。
「你說的是志保還是——」她靜了半晌，問。
「一開始請的就是你，」他看她，「不遲到是為了你，買咖啡是為了你，任你撒嬌耍賴是為了你，從頭到尾我愛的就是你。」
「那為什麼——」她發現自己不會說話了，只會說些殘次不全的語句。
「幫朋友的忙啊，」他微笑，「宮野說，對外宣布我倆相愛的事情，然後看白馬探的反應。」
「她很喜歡他嗎？」毛利蘭問。
「嗯，差不多吧，」他抱著她大步往前走。
「可是……你明明跟我說……我只是你朋友……」她的聲音越來越小。
「是朋友，不過前面要加一個字。」他笑得自信。
「什麼？」她追問。
「應該是女朋友。」他又一次抱緊她，找到一種安心的感覺。
心跳，沉穩而有力。
六、愛你
婚後，生活平靜而甜蜜。
她開始經常看報紙，尤其是在他在的時候。故意指著報紙上他的大頭像，念念有詞：「騙子啊騙子……」
「蘭，我真佩服你。」他看一眼她。
「怎麼了？」她反問。
「你竟然能捨身嫁給一騙子，有點兒犧牲精神。」
她瞪他：「說誰呢？！」
「說誰誰心裡最清楚！」他自信的反駁，站起身走到她面前，「我去上班了。」
她笑。
他低頭，在她唇瓣上落下一個吻：
「愛你。」
是這個嗎？
Ⅶ 名偵探柯南同人文(要完結，結局一定要是平和）
江戶川文代又一次來到毛利偵探所，說要帶柯南去游樂園。柯南以為她又是美希子所扮，便不加懷疑的跟上了文代的車。但在車上柯南卻被江戶川文代用手槍控制。原來她是黑衣組織的人，柯南的身份已經被組織完全發現了！
柯南在慌張中還是利用麻醉槍射中了偽裝成文代的敵人，在車子沖下大橋前逃脫，往阿笠博士家奔去。
與此同時Gin從學校綁架了少年偵探團，並威脅哀交出她研究APTX4869解毒葯的數據資料。哀為了救大家把資料給了組織，並被Gin押上了車。
而Gin在開走前卻暗中告訴Vodka在他離開之後就殺死少年偵探團的三人。
在Vodka要槍殺少年偵探團時，柯南終於找到了那裡救了大家，但Vodka還是逃走了。並說組織在等著工藤新一。
第二部份：沉睡的小五郎－覺醒！
柯南來到博士家用追蹤眼鏡找到了哀的下落。柯南留下了一張寫明一切的磁碟讓博士轉交給蘭，決定自己去面對黑色組織。
但磁碟被闖入博士家的英語老師Judy拿走了，原來她是黑衣組織上層安排在FBI的特工。阿笠博士用自己的新發明彈射坐椅欺騙了Judy，逃過一死來到了毛利家。當阿笠博士正想告訴小五郎和蘭現在的狀況時，卻發現坐在偵探所客廳里的毛利呈現出沉睡的小五郎的姿勢！而毛利面前的筆記本上寫著「工藤新一」「柯南」「黑衣組織」等等。
原來毛利早就懷疑了柯南，每次都配合扮演沉睡的角色就是為了調查出柯南的真實身份和整個事件。毛利在沉睡般的深思中展現出他真正的實力，通過柯南留下的磁碟資料推理出了黑衣組織的所在。
與此同時，FBI特工赤井秀一來到同事Judy家，意外的發現了的柯南的磁碟。他偷偷的把磁碟取回了家。秀一解開密碼後閱讀了柯南的自述以及對整個事件的推理。他對同事Judy的身份開始懷疑，但卻突然被人從後面擊昏。
而這時在米花町，放學回家的蘭在門口意外的聽見了小五郎和阿笠博士的對話，終於確定了柯南就是新一！蘭在淚水中決意要以性命為賭注，為救回新一與黑衣組織絕一死戰！
第三部份：小說家的意外訪客
赤井秀一被Judy帶回了組織。Gin威脅秀一加入組織，最後的考慮時間為2小時。
因為有了哀的數據和配合。兩小時之後，組織的葯物數據計算終於就可以完成。也就是傳說中的「同時成為上帝和魔鬼。讓時間倒轉，死人復活」葯物的完成。
在世界的另一邊，工藤優作和美希子也收到了博士的消息。優作第一次讓美希子進入了他的密室，原來這里就是工藤優作獨自對抗黑衣組織的總部。而小說家不過是個用來收集資料的幌子。
工藤優作和美希子明白決戰的時刻已經來臨。收拾裝備之時，前門突然出現了意外的訪客——目暮警官。
目暮警官撕下自己臉上的偽裝。優作驚訝的發現到來的客人居然是自己從學生時代便結交的死黨，自己還當了他兒子的教父！
他就是曾經揚名世界的偉大魔術家——黑羽先生！
優作看見10年前已經被判定為失蹤的老朋友非常吃驚。而黑羽開門見山的告訴優作，自己這十年也一直在獨自對著抗黑衣組織。方式就是讓自己的兒子黑羽快斗在世界范圍內尋找一塊特殊的寶石。而就在今天快斗卻給他發來了代表最後決戰的消息：關於寶石、新一、黑色組織以及人類的未來。他這才以黑羽的身份重新回到人間！而他的兒子也被人稱為平成的亞森羅賓。優作這才恍然大悟，原來自己的教子就是怪盜基德！
第四部份：最黑的黑色
柯南在傍晚來到了東京塔下，東京世界博覽會正在這里召開。原來黑衣組織的本部就是東京的中心！柯南騙過了警衛進入了地下室的暗門。
這里是另外一個地下王國。柯南利用阿笠博士交給他的電腦在警衛房間里侵入了黑衣組織的電腦中樞，正在向外傳播加密數據時，柯南意外的被人從後面擊昏，那個人居然又是Gin。
得到部份數據的阿笠博士將大家所擁有的信息整理到了一起，由優作和小五郎一起推理出了驚天的結論：黑衣組織的老闆可能就是日本前首相吉田元博，而天皇本人也是黑衣組織的的支持者！組織的一部分重要功能就是以非法手段達到日本的擴張！
而美國政府也早有察覺了這一點，並且指使FBI特工暗中介入。事實上美國也想通過操作組織來控制日本。
當分析出這一結論之時，毛利租來的車子已經開到了東京塔下。
關押赤井秀一的房門突然打開，走進來的是——「Sherry」。
第五部份：接近
畫面在赤井秀一的回憶中展開。他居然是宮野志保的童年最珍貴的夥伴，是唯一願意和宮野志保玩的孩子。也正是因為這樣，赤井秀一才在第一眼就解開了哀身份的迷題。
哀並不承認自己的身份，她說可以放走秀一，條件是要他永遠不要再回到這里。兩個人在爭吵的時候Judy出現了，秀一為救哀而死，留下遺言：「無論在那個世界，你叫什麼名字，我都能找到我的天使。」Judy黑色的槍口指向了哀。
這時毛利小五郎也闖入了組織內部，在組織訓練殺手的道場用空手道打敗了一群職業殺手。就在他洋洋得意之時，總教練出現了，居然是日本空手道冠軍風間仁。小五郎被打敗了，但跟蹤而至的蘭卻跳了出來，蘭在被風間的實力打入絕望之時耳邊傳來新一的呼喚，蘭終於爆發奧義，一擊之下擊倒了號稱不敗的風間。
Judy正要槍殺哀時，Gin突然出現了，把槍口對准Judy。他命令Judy放下槍，並說哀對組織還有用。Judy奇怪的問：「不是你要我到這里來殺死她的嗎？」Gin突然扣動扳機，一張撲克牌打中了Judy的手。原來這個Gin是基德扮成的。基德讓哀先去救柯南，自己在這里看著Judy。
哀跌跌撞撞的跑向控制牢房，而這一切都被組織內部的攝像機拍攝到了。
這時優作也已經趕到了東京，越來越多的信息匯集起來，在他的特殊計算機分析下顯示出了一個結論。優作看著屏幕目瞪口呆。
第六部份：真相只有一個
Gin和Vodka不知去向，哀順利的找到了柯南。原來在地下還有組織的列車，兩人乘著封閉的列車來到了組織的「聖殿」。
聖殿的正前方是一塊巨型液晶牆，上面出現的居然是前首相吉田的臉，他神色猙獰的說出一切。
秘密被完全的解開：基德和他的父親黑羽之所以以寶石為目標，並不是因為寶石值錢的原因，而是因為其中的一塊寶石並非出於地球，而是來自銀河系之外！它特殊的物質可以放出特殊的射線，改變細胞的分裂成長方向，從而讓細胞獲得永恆的生命！
為了在黑暗組織之前找到寶石，黑羽本人假裝葬身雪地，讓自己的兒子扮演怪盜來尋找寶石。但基德卻也一直沒能找到它。因為寶石很早就已經落入了黑衣組織之手，也正是在寶石射線的啟發下，黑衣組織才開始了「不死葯」的計劃。
但又因為想要合理的釋放出寶石的能量必須解開特殊的方程，需要設計出高級的程序來計算射線的不同狀態，組織於是才在世界范圍內招募最一流的電腦程序員。
屏幕上吉田所有的話被阿笠博士用無線電傳給了外面的毛利等人，大家都非常驚訝。哀說：「不要再躲躲藏藏了，快出來和我們一決勝負吧。」
「恐怕他是不會出來的。」柯南低下頭，眼鏡閃著銀色的光芒說出了令人震驚的話：「因為他早就死了。」
第七部份：人的戰斗
柯南完美無暇的推理出了不可思議的結果：吉田首相早在5年前就死去了，殺手正是這個地方的安全保衛系統。也就是說，現在黑衣組織的最高頭腦，就是這台具有人工智慧的電腦而已，它以利益時間比最大化的程序來發布組織的命令。
屏幕上的吉田哈哈大笑承認自己的身體的確因為心臟病而失去功能，但自己的腦組織結構和DNA數據被完整的保存在的超級計算機中。只要方程能夠被解開，自己就能獲得重生。這時電腦突然顯示射線的方程被解開了，重塑吉田的工程開始。
吉田哈哈大笑，但相關的機器突然爆炸。還是胚胎條件的新的軀體毀滅了。原來是電腦AI自己下了這個命令，並將吉田的所有數據都刪除了。AI認為自己完全統治黑衣組織才是最大化的利益。
這時大殿的頂棚突然打開，地面升了起來。柯南發現他們居然到了在停K在東京灣的巨輪甲板上。原來這艘作為黑衣組織大腦的巨輪長期飄盪在太平洋中央，用通訊衛星來操縱世界各地的成員。
站在甲板上迎接他們的是持槍而立的Gin。
Gin向柯南扣動了扳機。
第八部份：江戶川柯南VS工藤新一
哀擋住了射向柯南的子彈，倒在柯南的面前，Gin步步逼近。巨輪的自動排外系統啟動。目標是一切生命體，Gin被桅桿的狙擊槍射中，一發又一發直到確認心臟停止。
柯南死死的擋在哀的身上，萬幸的是他們的因為目標過小不予判定。
天空漸漸就要亮了，哀微笑著拿出粘血的葯丸，世界上唯一的一顆APTX4869解葯。
「柯南，好想永遠和你在一起。但我們沒有機會了吧。」哀握著解葯的手伸向柯南的臉：「吃下去吧。」
「笨蛋！這顆解葯只要得救之後分析成分就能復制了啊！」柯南抱緊了哀。
「不要。」哀突然大聲的咳嗽起來，在一瞬間把葯塞進柯南的嘴裡。「你還不明白嗎？」哀看著柯南意外的吞下葯丸，緩緩露出笑臉：「這是科學和推理無法解釋的問題呢！」哀在閉上眼睛的時候用只有柯南聽得見的聲音說：「不是工藤新一。我愛的人，是江戶川柯南。」
「哀——」葯物和心意一起讓柯南感覺無比疼痛，他昏了過去。
優作和小五郎在突然之間靈光一閃。優作終於找到了破解這個由科學與邏輯組成的巨大機器的銀色子彈。
第九部份：銀色彈丸，我們的約定
人類擊潰一切邪惡與魔鬼的銀色彈丸就是無可代替的「愛」。「愛」就是科學與邏輯永遠無法解釋的程序。
工藤優作發送的銀色彈丸在以瞬間傳導到了電腦中樞。超級計算機由於溢出的計算以及以及無法模擬程序方式而最終崩潰。巨輪倒數五分鍾的自爆裝置開始啟動。新一在迷迷糊糊中聽見了熟悉的呼喚：「新一！新一！」還有直升機的聲音。
一切都結束了：巨輪在太陽升起的時候爆炸了。
新一坐在了海邊見那種比太陽還要耀眼的光芒，暗想：「江戶川柯南已經不存在在這個世界了。他已經和哀一起去了屬於他們的幸福花園。而我……」他轉過頭看見立在身後淚水瑩瑩的蘭。
「終於實現了，我們的約定！」新一把蘭緊緊的抱在懷里，很久很久。
新一突然看見站在遠處朝霞里的少年偵探團，他習慣性的想跑過去和大家一起，但腳步又突然停住。新一緩緩的轉過身去，用只有自己能聽見的聲音說：「大家，再見了。」
他慢慢的往另一邊的人群中走去，沒有回頭，咬緊牙齒淚水居然都忍不住模糊了眼睛。一顆很大的淚珠突然滑落，之後更多的淚水緊隨其後落下。
新一聽見步美的聲音：
「再見了，柯南同學。」
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